Судебную экспертизу назначает суд — не стороны. Расходы на экспертизу несёт сторона, по ходатайству которой она назначена, или суд распределяет их между сторонами. При положительном решении суд, как правило, взыскивает судебные расходы, включая экспертизу, с проигравшей стороны — то есть с государственного органа.